日本练习舰队“须磨”号和“明石”号在远洋航行途中，即将穿越南洋中心时，听闻一座正在建设的漂浮飞行岛的消息。在参观飞行岛时，川上机关大尉离奇失踪，衣物却留在舰上，这引发了一系列谜团。杉田二等水兵为探寻川上的下落，毅然脱舰前往飞行岛，却不幸被抓。原来，这座飞行岛隐藏着巨大阴谋，它其实是英国建造的超级航空母舰，英国与苏联企图借此对日本发动攻击。川上机关大尉秘密潜伏在飞行岛，不断收集情报并与外界联系。随着局势愈发紧张，川上机关大尉的命运会如何发展？他能否成功阻止英苏的阴谋？