自咸丰十一年（1861）始直至辞世，莫友芝先后依托于胡林翼、曾国藩、李鸿章、丁日昌、庞际云等大僚，不但亲历或得闻诸多重要事件，而且得与天下俊彦结交，他的《?亭日记》便主要写于这一时期。咸丰十一年正月初一至五月三十日日记，除台湾地区“国家”图书馆藏手稿外，上海图书馆和扬州图书馆还分别藏有钞本，“中国嘉德2012年拍卖会”还拍卖过另一种钞本。比起手稿，他们在内容上都有简略或误钞，扬州图书馆的还脱佚了咸丰十一年二月初一至二十六日部分。同治八年正月初一开始，《?亭日记》开始出现数日一记甚至数月一记的现象，这可能由于莫友芝晚年精力不济或事务繁冗所致。本书便以上述诸种手稿的复印件为底本，它们基本上能够反映晚年莫友芝的主要经历。