《神奇教室（内蒙古篇）：飞往恐龙的故乡》以内蒙古为坐标，故事讲述了赵一鸣的爸爸是一位考古学家，一次野外勘察中发现了一块恐龙化石，由于他腿部受伤严重，将化石带到内蒙古二连浩特国家地质公园的任务就交给103班的同学们了。华优优老师和孩子们乘上泡泡飞马，经过辉腾锡勒风电场时，强劲的大风吹掉了装着化石的小盒子。大家来到内蒙古博物馆向不倒翁莫顿打探消息，会弹奏码头琴的莫顿送给孩子们一串串跳动的音符，指引小家伙们找到淘气的风小孩，原来是他的恶作剧，吹跑了小盒子。可是这时的小盒子仍不见踪影。一路上寻找的经历，大家走过了响沙湾、看到了草原夜晚美丽的星空，还和草原上的牧民一同救援暴风雨中失散的羊群、参加草原那达慕大会……103班孩子们和风小孩、小铜人阿乐、一个蒙古族小女孩成了要好的朋友，装化石的小木盒也终于在大家的齐心协力下重新找回。这场内蒙古的历险，对当地的历史文化有了更深刻的了解和记忆。