除了在想变成吸血鬼这一点之外，小学六年级的阳太和普通的小学生没有任何区别。阳太有一个有点古怪的叔叔――夜之介，一个在阳太家的阁楼白吃白住的作家。这样一对叔侄俩，有一天在电视上看到要对〔东京站〕进行的大改造的消息，他们就把这作为了暑假自由研究的题目。为了搜集材料而马上动身去往〔东京站〕的两人，居然在迷宫一样的火车站内的太　平间发现了一幕惊人场景！并且那天半夜，在叔叔夜之介的旅馆房间内发生了密室杀人案！叔叔也消失得无影无踪。这难道是一起连续杀人事件吗？夜之介叔叔到底是何方神圣？阳太和想成为一名侦探的同学留美花一起，为了揭开谜团而奔走……